2022年10月，国家事业单位管理局事业单位登记系统注册登记我校现代农业发展研究院为事业单位类新型研发机构。2021年11月，现代农业发展研究院由中共吉安市委编委办公室批复设立为不核定机构编制的事业单位类新型研发机构（举办单位为井冈山大学、吉安市科技局）。该研发机构的获批将为我校应用转型服务地方提供新的平台和渠道，同时具备了申报省级新型研发机构的前提条件，并拥有获得政府《进一步加大井冈山农业高新技术产业示范区政策支持措施》中特别给予高等院校和科研院所在农高区注册新型研发机构或共建平台相关政策红利的主体资格。

现代农业发展研究院为积极履行《井冈山大学  吉安市人民政府建设井冈山国家农业高新技术示范区合作框架协议》，助力提升井冈山农业科技园科技创新能力，助推农业科技园升建国家级农高区，自成立以来聚焦升建关键领域任务，满足农高区科研机构建设要求。目前中科院、省科学院、省农科院、江西农大和我校均在井冈山农高区内注册建立了事业单位类新型研发机构。